現場調查結果表明,黃巖島藍洞洞口面積約為1491.7平方米,洞口最大直徑為56.3米,深度為16.6米,內部結構呈漏鬥狀,洞底狹窄,洞內水體存在濁度分層。基於放射性碳-14同位素測年等地質年代學研究初步顯示,黃巖島藍洞至少形成於距今3200年前。多年來,黃巖島潟湖內相鄰尖礁或(和)點礁不斷發育,在氣候變化、海平面升降等多重自然因素影響下,礁體之間通過橫向擴張和膠結作用最終形成閉合,可能是黃巖島藍洞形成的主要原因。
黃巖島藍洞及周邊海域生物多樣性豐富,洞內分布著珊瑚、硨磲、魚類、海綿、海葵等珊瑚礁典型生物類群,洞內及洞口周邊發現有國家一級保護野生動物綠海龜棲息活動,其周邊海域連續兩年調查累計記錄造礁石珊瑚165種、魚類184種,利用環境DNA技術發現海洋生物超2700種。黃巖島藍洞的發現與深入研究,將為黃巖島地質演化、南海古環境與生物多樣性演變、全球與區域氣候變化影響研究等提供重要科學信息,並對揭示海洋藍洞這一特殊生態系統的形成演化機制及其生態效應發揮重要科學價值。
2025年9月,中國政府建立黃巖島國家級自然保護區,本次調查結果彰顯黃巖島海域生態保護的積極成效。下一步,生態環境部華南環境科學研究所將會同有關科研機構,進一步聚焦黃巖島藍洞成因機制、生態環境演變規律、生態系統功能以及藍洞對黃巖島自然生態系統高生物多樣性貢獻等方面,開展更加深入、系統、全面的調查研究,為進一步加強南海生態系統和生物多樣性保護等提供科學支撐。