據政府新聞處今日（8日）公佈，重建後的皇崗口岸預計於今年第四季正式投入服務，並將採用嶄新的「合作查驗、一次放行」通關模式。入境事務處估計，口岸開通初期每日至少有十萬人次出入境。為提升旅客通關效率，合資格香港居民即日起可透過「香港e-道」流動應用程式，預先登記使用合作查驗自助通道。
新皇崗口岸設有134條合作查驗自助通道及68個傳統人工櫃枱。在新模式下，已登記旅客排隊及出示證件均只需一次，即可同時完成港深兩地的出入境手續，整體通關時間將由原來約30分鐘大幅縮減至約5分鐘。
港人申請資格與登記方法
凡年滿7歲或以上並符合資格的香港居民均可登記使用合作查驗自助通道。合資格人士包括：
- 持有香港永久性居民身份證及回鄉證，並已登記內地快捷通道者；
- 持有香港永久性居民身份證及《港澳居民來往內地通行證（非中國籍）》，並已登記內地快捷通道者；
- 持有香港居民身份證及回鄉證，並已登記內地快捷通道者；
- 持有香港居民身份證及往來港澳通行證（附有效赴港簽注）者。
登記途徑：
- 手機App登記：年滿18歲合資格港人可透過「香港e-道」App選擇「合作查驗」，經「智方便」核實身分後完成登記；7至17歲合資格港人須由父母或合法監護人透過App代辦。
- 即場辦理：合資格港人可至皇崗口岸設置的e-道登記處或自助服務站即場登記；年滿18歲合資格港人及內地訪客，更可在合作查驗自助通道同時辦理登記並通關。
- 刷臉通關：年滿14歲或以上的合資格港人及內地訪客，在登記時可一併登記「刷臉通關」服務，實現免出示證件通關。
入境事務處助理處長汪奇在記者會上表示，口岸開通初期現場會安排足夠人手解答旅客疑問。入境處同時提醒，旅客使用合作查驗自助通道時仍須攜帶有效旅行證件，亦可選擇傳統人工櫃枱辦理手續。
車輛清關採全新三閘門 流程壓縮至2分鐘
車輛清關方面，海關介紹在「合作查驗、一次放行」模式下，離境車輛須先經過海關前置亭接受風險評估，再駛入聯合一站式車道。
該車道採用全新三度閘門設計及信息採集一體機，司機只需使用一張證件，即可一次過完成體溫、證件、容貌及指紋資料採集，實現「五方查驗、一次放行」。海關助理關長（邊境及港口）蔣依莉指出，原有落馬洲/皇崗口岸乘客下車檢查流程需時約10分鐘，新皇崗口岸聯合一站式車道將整個流程壓縮至約2分鐘。
